项新研究发现
最近的一项全球研究汇编了一份在海 美国数据中的电话号码列表 鲜市场上发现的野生动物物种清单，这些物种被认为是2019 年末导致 COVID-19 大流行的病毒SARS-CoV-2 的来源。这项研究基于中国疾病预防控制中心 (CDC) 提供的新宏转录组数据分析。
这些数据来自自 2020 年 1 月 1 日起在华南海鲜批发市场及其周边地区采集的 800 多个样本，以及早期 COVID-19 患者报告的病毒基因组。这项研究于 9 月 19 日发表在《 细胞》杂志上。
“这是关于 COVID-19 疫情起源的最重要的数据集之一，”法国国家科学研究中心 (CNRS) 的共同通讯作者 Florence Débarre 说道。“我们非常感谢这些数据的存在和分享。”
斯克里普斯研究中心的共同通讯作者克里斯蒂安·安德森 (Kristian Andersen) 说：“这篇论文为越来越多的证据又增添了一层，所有证据都指向同一种情况：被感染的动物于 2019 年 11 月中下旬被引入市场，从而引发了疫情。”
“我们以新颖而严谨的方式分析了中国疾控中心团队收集的至关重要的数据，”亚利桑那大学的共同通讯作者迈克尔·沃罗贝 (Michael Worobey) 表示。“这是对这些数据的权威分析，以及它如何与我们掌握的有关疫情如何开始的其他大量证据相吻合。”
2020年初市场调查
2020 年 1 月 1 日，在动物被运走后，也就 董事会成员可以给非营利组织提供的 5 件无价礼物 是市场关闭几个小时后，中国疾控中心的调查人员前往市场采集样本。他们擦拭了摊位的地板、墙壁和其他表面；几天后他们又回来重点检查了野生动物摊位的表面，例如笼子和用于移动动物的推车，然后还从排水沟和下水道采集了样本。
他们对样本进行了宏转录组测序，该技术旨在从样本中存在的所有生物体（病毒、细菌、植物、动物、人类） 获取所有RNA序列（也可以提取DNA ）。由刘军领导的中国疾控中心团队于 2023 年在《自然》杂志上发表了他们的数据和结果。然而，该文章并未确定数据中发现的可能代表中间宿主的动物物种的确切身份。中国疾控中心在公共和开放存储库上分享了他们的测序数据。
根据《细胞》杂志发表的对这些数据的最新分析 ，SARS-CoV-2 存在于市场上出售的一些野生动物摊位中，包括貉（一种小型狐狸状动物，有与浣熊相似的斑纹）和果子狸（与猫鼬和鬣狗有关的小型食肉哺乳动物）。在某些情况下，甚至在同一拭子上发现了 SARS-CoV-2 病毒和这些动物的遗传物质。通过对样本中的线粒体基因组进行基因分型，可以确定确切的动物种类。
“许多主要动物物种在中国疾控中心团队抵达之前就已被清除，因此我们无法直接证明这些动物已被感染，”德巴尔说。“我们在环境样本中看到了这些动物的 DNA 和 RNA 痕迹，有些在发现 SARS-CoV-2 的畜栏中也发现了痕迹。如果市场上有受感染的动物，你就会想到会出现这种情况。”
“我们知道，正是这些动物促成了 2002 年最初的 SARS 冠状病毒传播到人类，”Worobey 补充道。“这是我们能做的最危险的事情——捕捉携带病毒的野生动物，然后让它们与居住在大城市中心的人类接触，这无异于玩火，因为大城市人口密度高，病毒很容易在这里扎根。”
进化分析与市场溢出
该国际团队还对疫情中最早报告的病 ew 线索 毒基因组（包括这些环境序列）进行了进化分析，并推断出感染人类并导致 COVID-19 疫情的病毒最有可能的祖先基因型。结果表明，在市场爆发之前，感染的人类非常少，甚至没有。这与市场内从动物到人类的溢出效应一致。在直接上游的动物贸易中，可能也存在影响有限的溢出效应。
“在本文中，我们表明与市场相关的序列与市场的出现相一致，”Débarre 说。“SARS-CoV-2 的主要多样性从一开始就存在于市场中。”
这项新研究列出了海鲜市场中与病毒样本同时出现或接近出现的动物物种的简短清单，这些动物物种可能代表 SARS-CoV-2 最有可能的中间宿主。貉是一种易受 SARS-CoV-2 感染的物种，在 2003 年携带 SARS-CoV，在海鲜市场野生动物摊位的样本中，它被发现是基因最丰富的动物。果子狸的遗传物质也与早期的 SARS-CoV 爆发有关，在带有 SARS-CoV-2 RNA 的摊位中也发现了果子狸的遗传物质。在 SARS-CoV-2 阳性样本中还发现了其他物种，例如灰竹鼠和马来豪猪，以及许多其他物种。
虽然数据无法证明其中一只或多只动物是否已被感染，但研究小组的分析提供了一份最有可能携带病毒的物种清单，以及可用于帮助追踪其来源地的基因信息。
研究人员强调了解 COVID-19 疫情起源的重要性，尤其是考虑到近期其他疫情蔓延，例如美国牛群中禽流感病毒的传播。“关于 SARS-CoV-2 的起源存在大量虚假信息和错误信息，”Worobey 说。“查明真相非常重要，因为这不仅影响美国的国家安全和公共卫生，还影响全世界。事实是，自四年多前疫情爆发以来，尽管人们更加关注实验室安全，但并没有采取太多措施来降低此类人畜共患疫情再次发生的可能性。”
